Hallo Kasia,
das klingt in der Tat etwas paradox, deshalb geht es nun weit ab vom ursprünglichen Thema. Hoffentlich rauft sich Heike wegen mir nicht schon die Haare

Bakterien sind vereinfacht wie folgt aufgebaut: Sie haben eine feste Kapsel als Hülle und die DNA liegt als Ring frei in einem Bereichs des Cytoplasma vor. Man spricht hier von einem Nucleoid (am besten zu übersetzen mit Kernäquivalent), aus diesem Grund werden solche Organismen auch als Procaryoten zusammengefasst. Für weitere Informationen verweise ich mal auf Wikipedia:
http://de.wikipedia.org/wiki/BakterienBei den Protozoa sieht es etwas komplexer aus, die DNA liegt in einem von einer Doppelmembran umgebenen Kompartiment vor, dem Zellkern (Nucleus). Daher spricht man hier von Eucaryoten, da ein echter Zellkern vorhanden ist. Die Zelle ist nicht von einer Kapsel umgeben sondern wird von einer Membran begrenzt. Im Cytoplasma finden sich noch weitere Kompartimente, die Organellen der Zelle (äquivalent zu den Organen vielzelliger Organismen). Diese Organismen ähneln in ihrem Aufbau sehr stark den Zellen von Vielzellern, sind aber Einzeller oder Kolonien einiger Zellen. Das ist auch der Grund für den Namen Protozoa, für den mir momentan auch keine halbwegs vernünftige Übersetzung einfällt. Da ich auch etwas schreibfaul bin, verweise ich hier ebenfalls auf Wikipedia
http://de.wikipedia.org/wiki/ProtozoenDas ist auch der Grund warum die meisten Antibiotika nicht bei Protozoen wirken. Jedoch gibt es da auch einige Ausnahmen wie z.B. Trimethoprim – Sulfonamid Kombinationen.
Edit: Einige TA erheben auf die Untersuchungskosten noch einen Aufschlag, das ist dann der Grund für die unterschiedlichen Preise. Wenn man gut mit seinen TA steht wird dieser die Kosten nur weiterreichen, ansonsten sollte man die Probe selbst einsenden. Das hat zudem den Vorteil, dass man selbst bestimmen kann auf was untersucht werden soll. Die Gründe hat ja Kasia schon genannt.